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書名

超入門! R でできるビジュアル統計学 解析編 学会・論文発表に役立つデータ可視化マニュアル

筆頭著者

藤井亮輔・他著

出版社名

金芳堂

ISBNコード

ISBN978-4-7653-1950-8

発行年

2023年3月

判型 / 頁数

B5変型判 / 184頁

分類

医学一般/医療統計学・医学情報学

価格

定価3,740円(本体3,400円 税10%)

内容

医療系の論文でよく使われる統計手法、解析手法の図示を洗練させるにはどうしたらよいのか? 統計解析したあとの処理がわかる!

目次

Part1 Rの紹介と前準備
[1-1]RとRStudioの基本
[1-2]データのインポートと前処理
[1-3]ggplot2の基本
本書で使用するデータセット一覧
本書で使用するパッケージのインストールと呼び出し

Part2 相関と回帰分析の可視化
[2-1]相関係数のヒートマップ(Correlation matrix)
[2-2]回帰分析1―線形な関係(Regression analysis: Linear relationship)
[2-3]回帰分析2―非線形な関係(Regression analysis: Non-linear relationship)
[2-4]回帰分析3―点推定値と信頼区間(Point estimate and confidence interval)

Part3 因果推論の可視化
[3-0]因果推論の導入
[3-1]傾向スコア分析(Propensity score regression analysis)
[3-2]回帰不連続デザイン(Regression discontinuity design)
[3-3]差分の差分法(Difference in differences design)
[3-4]DAG(Directed acyclic graph)

Part4 メタアナリシスの可視化
[4-1]フォレストプロット(Forest plot)
[4-2]ファンネルプロット(Funnel plot)
[4-3]ネットワーク・メタアナリシス(Network meta-analysis)

Part5 生存時間解析の可視化
[5-1]生存曲線(Survival curve)
[5-2]スイマープロット(Swimmer plot)
[5-3]スパイダープロット(Spider plot)

Part6 臨床検査学・診断学の可視化
[6-1]ROC曲線(Receiver operating characteristic curve)
[6-2]ブランド・アルトマンプロット(Bland-Altman plot)

Part7 生命医科学の可視化
[7-1]次元圧縮(Dimensionality reduction)
[7-2]ボルケーノプロット(Volcano plot)
[7-3]系統樹(Phylogenetic tree)

BOX
1-1 RとRStudioの役割とメリット
1-2 SourceペインとConsoleペインの役割
1-3 Rコマンドの注意点
2-1 エラーメッセージの解決策
3-1 調整変数の選択方法~バックドア基準を基に~
4-1 ファンネルプロットが非対称性になるメカニズム
6-1 感度と特異度

Column
1 gtsummaryパッケージによる表での可視化
2 画像の保存形式(ビットマップ/ベクター)
3 記述統計に関する発展的な可視化
4 欠測値の可視化
5 データハンドリングのTips

索引
あとがき
著者プロフィール